Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORCS2Q96PQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SORCS2Q96PQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms