Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD11Q96NU1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD11Q96NU1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms