Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms