Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
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LRRIQ1Q96JM4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRIQ1Q96JM4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
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