Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX3Q96JJ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX3Q96JJ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms