Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT2BQ96GJ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT2BQ96GJ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms