Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms