Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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