Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMIGD2Q96BF3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms