Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1MTQ969P6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1MTQ969P6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms