Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS9Q8WXC6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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