Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 NSRP1-211ENST00000584154 583 ntTSL 310.7□□□□□ -0.76e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.716e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RIC8B-204ENST00000462949 3389 ntTSL 210.57□□□□□ -0.726e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.736e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-207ENST00000426649 660 ntTSL 210.22□□□□□ -0.776e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-210ENST00000583301 684 ntTSL 310.2□□□□□ -0.786e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 510.17□□□□□ -0.786e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.786e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.786e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-216ENST00000465706 526 ntTSL 510.09□□□□□ -0.796e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-201ENST00000247026 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.816e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 IL18RAP-201ENST00000264260 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.836e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SGK1-202ENST00000367855 2422 ntTSL 59.78□□□□□ -0.846e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.896e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-240ENST00000562292 735 ntTSL 59.38□□□□□ -0.916e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SGK1-203ENST00000367857 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.916e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.926e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.926e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SGK1-213ENST00000477460 1896 ntTSL 29.3□□□□□ -0.926e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 C2orf42-201ENST00000264434 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.946e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-216ENST00000557079 722 ntTSL 39.03□□□□□ -0.966e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.976e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 38.99□□□□□ -0.976e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.976e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.986e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SGK1-201ENST00000237305 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.996e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MED1-203ENST00000577831 4584 ntTSL 28.68□□□□□ -1.026e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.036e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.036e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-202ENST00000394826 1800 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.046e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.096e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.136e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.146e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.156e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 57.58□□□□□ -1.26e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 37.53□□□□□ -1.26e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SMIM20-203ENST00000515764 773 ntTSL 57.38□□□□□ -1.236e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-207ENST00000577289 562 ntTSL 57.34□□□□□ -1.236e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC7.3□□□□□ -1.246e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.246e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.266e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SMIM20-204ENST00000522137 427 ntTSL 27.16□□□□□ -1.266e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-211ENST00000436603 552 ntTSL 37.01□□□□□ -1.296e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.326e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-214ENST00000555660 333 ntTSL 36.76□□□□□ -1.336e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-212ENST00000584317 564 ntTSL 56.01□□□□□ -1.456e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.456e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.486e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-204ENST00000475652 1242 ntTSL 1 (best)5.61□□□□□ -1.516e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.516e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.547e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RIC8B-206ENST00000470960 3921 ntTSL 24.87□□□□□ -1.636e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.646e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SGK1-210ENST00000474427 5474 ntTSL 24.8□□□□□ -1.646e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.726e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.736e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 TFB1M-203ENST00000468889 621 ntTSL 34.09□□□□□ -1.756e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.7□□□□□ -1.826e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.836e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-214ENST00000585881 582 ntTSL 33.57□□□□□ -1.846e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.916e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.946e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 DOPEY1-205ENST00000484282 5473 ntTSL 22.81□□□□□ -1.966e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.976e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.086e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-10■■■■■ 38.2
PUM2Q8TB72 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 38.2
PUM2Q8TB72 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-10■■■■■ 38.2
PUM2Q8TB72 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-10■■■■■ 38.2
PUM2Q8TB72 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 38.2
PUM2Q8TB72 KLHDC2-209ENST00000556559 751 ntTSL 56.62□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 38.1
PUM2Q8TB72 KLHDC2-210ENST00000557063 827 ntTSL 26.62□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 38.1
PUM2Q8TB72 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 ELMSAN1-208ENST00000476562 5314 ntTSL 219.47■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 213.95□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 CSNK1D-224ENST00000584672 401 ntTSL 312.39□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 312.31□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 EPC1-202ENST00000319778 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-10■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.81e-10■■■■■ 38
PUM2Q8TB72 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-19■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 CNEP1R1-210ENST00000568890 1992 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 CNEP1R1-205ENST00000565457 1744 ntTSL 59.59□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 AAED1-202ENST00000411939 2514 ntTSL 38.19□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 AAED1-203ENST00000446045 2723 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 37.9
PUM2Q8TB72 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 37.9
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