Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC103Q8IW40 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC103Q8IW40 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC103Q8IW40 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC103Q8IW40 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC103Q8IW40 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC103Q8IW40 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCDC103Q8IW40 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC103Q8IW40 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms