Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX7Q7RTT5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms