Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS5

CCDC121, Coiled-coil domain-containing protein 121, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC121Q6ZUS5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC121Q6ZUS5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC121Q6ZUS5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms