Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00299Q6ZSB3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms