Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIAT1Q6ZQX7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIAT1Q6ZQX7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIAT1Q6ZQX7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIAT1Q6ZQX7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIAT1Q6ZQX7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIAT1Q6ZQX7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms