Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms