Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCIMPQ6UWF3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms