Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms