Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD40Q6AI12 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms