Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNS3Q68CZ2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNS3Q68CZ2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms