Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf53Q5VUE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf53Q5VUE5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf53Q5VUE5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf53Q5VUE5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf53Q5VUE5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms