Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH8Q5T0T0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms