Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAP1Q5SW96 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDLRAP1Q5SW96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms