Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO47Q5MNV8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms