Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC158Q5M9N0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms