Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N2

LGALS9B, Galectin-9B, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9BQ3B8N2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LGALS9BQ3B8N2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGALS9BQ3B8N2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms