Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTL8BQ17RB0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTL8BQ17RB0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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