Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPROQ16827 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPROQ16827 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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