Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms