Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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SEC23BQ15437 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEC23BQ15437 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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