Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABEP1Q15276 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABEP1Q15276 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
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