Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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