Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFIXQ14938 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIXQ14938 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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