Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMCO1Q147U7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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