Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOFQ13790 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOFQ13790 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOFQ13790 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOFQ13790 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOFQ13790 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOFQ13790 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOFQ13790 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOFQ13790 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOFQ13790 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOFQ13790 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOFQ13790 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOFQ13790 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOFQ13790 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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APOFQ13790 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOFQ13790 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOFQ13790 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOFQ13790 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOFQ13790 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOFQ13790 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOFQ13790 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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