Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL3Q13618 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CUL3Q13618 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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