Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms