Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EIF4EBP1Q13541 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms