Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED1Q13445 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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