Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRSQ13332 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRSQ13332 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms