Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF6Q13247 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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