Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX4Q12846 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STX4Q12846 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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STX4Q12846 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STX4Q12846 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STX4Q12846 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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