Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA6Q01524 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms