Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFI35P80217 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFI35P80217 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFI35P80217 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFI35P80217 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFI35P80217 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFI35P80217 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFI35P80217 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFI35P80217 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFI35P80217 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms