Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
JAG1P78504 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JAG1P78504 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAG1P78504 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAG1P78504 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
JAG1P78504 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAG1P78504 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAG1P78504 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
JAG1P78504 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
JAG1P78504 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
JAG1P78504 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAG1P78504 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAG1P78504 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms