Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO4P61968 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO4P61968 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO4P61968 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms