Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK1P57059 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIK1P57059 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SIK1P57059 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK1P57059 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK1P57059 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK1P57059 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK1P57059 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK1P57059 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK1P57059 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK1P57059 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK1P57059 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK1P57059 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK1P57059 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK1P57059 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIK1P57059 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIK1P57059 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SIK1P57059 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SIK1P57059 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SIK1P57059 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIK1P57059 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIK1P57059 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIK1P57059 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIK1P57059 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms