Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms